Fran Kurniawan/Pia Zebadiah kembali membuat kejutan. Di hari ketiga yang memainkan babak kedua, Fran/Pia menggagalkan usaha unggulan ketujuh asal Korea Selatan Baek Cheol Shin/Hyun Young Yoo untuk melangkah jauh ke babak perempat final.  Tak tangung-tanggung pasangan Korea Selatan ini takluk dua set langsung dengan 11-21,  18-21. Seluruh pasangan ganda campuran Indonesia lainnya yang bermain di babak kedua juga melenggang ke babak perempat final. Muhammad Rijal/Debby Susanto menghentikan pasangan Jepang Kenichi Hayakawa/Shizuka Matsuo dengan 21-15, 21-15.

Sementara dua pasang unggulan asal Indonesia, meski lolos ke babak perempat final namun harus dilewati dengan bermain rubber game. Unggulan keenam Akhmad Tantowi/Liliyana Natsir harus bermain selama 38 menit untuk menghentikan perlawanan pasangan dari China Taipei Chen Hung Ling/Cheng Wen Hsing. Di set pertama pasangan China Taipei ini selalu unggul dalam raihan angka. Hingga jeda set pertama pasangan China Taipei ini unggul 11-6. Akhmad/Liliyana sempat menyamakan kedudukan menjadi 19-19, namun pasangan China Taipei menutup set pertama dengan kemenangan dan skore menjadi 21-19. Di awal set kedua, pasangan China Taipei sempat memimpin dengan 8-4. Tak mau mengulangi kesalahan yang sama seperti pada set pertama, Akhmad Tantowi/Liliyana Natsir membalikkan keadaan. Meski kedudukan sempat disamakan menjadi 12-12, pasangan Indonesia ini hanya memberi tambahan dua angka untuk pasangan China Taipei dan mengakhiri set kedua dengan 21-14. Pada set penentuan, permainan Akhmad/Liliyana semakin solid. Pasangan China Taipei hanya mampu menyamakan pada saat angka 1 -1. Setelah itu pasangan Indonesia melesat hingga 21-12 dan memastikan satu tempat di babak perempat final.

Hendra Aprida Gunawan/Vita Marissa yang menjadi pimpinan unggulan ganda campuran malah harus bermain lebih lama lagi yakni selama 46 menit. Pasangan yang menjadi semifinalis Li Ning Singapore Open Super Series 2010 ini menghentikan perlawanan pasangan dari China Taipei Lee Sheng Mu/Chien Yu Chin. Meski selalu memimpin dalam perolehan angka, Hendra/Vita gagal dalam menyelesaikan set pertama dan  menyerah dengan angka sangat ketat 25-27. Di set kedua pasangan China Taipei hanya mampu menyamakan kedudukan pada angka 8-8 sebelum akhirnya Hendra/Vita menang dengan 21-16. Keadaan menjadi lebih mudah di set ketiga bagi Hendra/Vita. Perlawanan pasangan China Taipe tidak seganas seperti set pertama. Hendra/Vita menutup set ketiga dengan 21-12. Dengan hasil ini Indonesia memastikan satu tiket di semifinal dan harus diperebutkan antara pasangan Hendra Aprida Gunawan/Vita marissa dengan Muhammad Rijal/Debby Susanto. Jika ingin menembus babak semifinal, Fran Kurniawan/Pia Zebadiah harus mampu mengalahkan unggulan ketiga dari Thailand Songphon Anugritayawon/Kunchala Voravichitchaikul. Akhmad Tantowi/Liliyana Natsir di perempat final akan bertemu pemain Korea Selatan Yi Goo Kwon/Ye Na Jang.

Setelah menang atas Vita Marissa/Saralee Thoungthongkam dengan 21-17, 21-19, pasangan ganda putri Meliana Jauhari/Greysia Polii kembali akan menantang unggulan kedua asal Malaysia Wong Pei Tty/Chin Eei Huy pada babak perempat final. Kedudukan Sementara Head to head antara kedua pasangan ini masih di pegang oleh pasangan Indonesia dengan 2-0. Terakhir keduanya bertemu pada putaran final Thomas-Uber 2010 yang dilangsungkan di Malaysia. Saat itu Meliana/Greysia menang 26-24, 21-18. Pasangan Malaysia inilah yang pada babak kedua menghentikan perlawanan Anneke Feinya Agustine/Annisa Wahyuni dengan 21-10, 23-21. Pia Zebadiah/Debby Susanto juga harus terhenti di babak kedua setelah kalah dari unggulan utama Miyuki Maeda/Satoko Suetsuna (Jepang) dengan 7-21, 13-21.
Di ganda putra, Indonesia hanya tinggal menyisakan dua pasang pemain pada babak perempat final, yakni unggulan kedua Markis Kido/Hendra Setiawan serta unggulan ke tiga Alvent Yulianto/Hendra Aprida Gunawan. Pada babak kedua, Markis Kido/Hendra Setiawan masih terlalu tangguh bagi pasangan Malaysia Peng Soon Chan/Kim Wah Lim. Peraih medali emas Olimpiade Beijing ini menang dengan 21-18, 21-16. Sementara itu Alvent Yulianto/Hendra Aprida Gunawan meski harus bermain rubber game, tetapi akhirnya menang atas Ki Jung Kim/Caek Cheol Shing dari Korea Selatan dengan 21-17, 21-23, 21-17. Satu pasang ganda putra, Rian Agung Saputro/Angga Pratama tersingkir di babak kedua dari pasangan Jepang Hiroyuki Endo/Kenichi Hayakawa. Meski kalah pasangan pelatnas pratama ini mampu memberikan perlawanan dengan rubber game sebelum akhirnya kalah dengan 11-21, 21-17, 18-21.